25 ноября 1943 года в соответствии с Постановлением Государственного Комитета Обороны № 2539 была образована кафедра физиотерапии с курсом лечебной физической культуры и механотерапии, которую возглавил полковник медицинской службы профессор Б.М. Бродерзон, а курс ЛФК — майор медицинской службы доцент Д.А. Винокуров.
Первый коллектив кафедры. г. Самарканд
Кафедра явилась научно-методическим центром подготовки начальников физиотерапевтических отделений и отделений лечебной физической культуры полевых военно-медицинских учреждений и восстановительного лечения лиц с боевой хирургической травмой и ее последствиями. За годы войны физиотерапией было охвачено свыше 13 млн. военнослужащих, что составило 76% раненых и больных, разработаны и апробированы основные положения военно-полевой физиотерапии. В июне 1962 г. в период сокращения Вооруженных Сил кафедра вновь была преобразована в курс физиотерапии и курортологии в составе кафедры пропедевтики внутренних болезней (профессор А.П. Сорокин). Заведующим курсом был назначен профессор А.П. Парфенов, а сам курс размещен на базе клиники пропедевтики внутренних болезней в здании бывшей Обуховской больницы (наб. Фонтанки, 106), где располагается ныне кафедра курортологии и физиотерапии с курсом медицинской реабилитации.
1 марта 2001 года в соответствии с Директивой Генерального Штаба ВС РФ от 31 октября 2000 года № 314/6/2874 в штате Академии была восстановлена кафедра курортологии и физиотерапии с курсом медицинской реабилитации, начальником которой был назначен полковник медицинской службы профессор Г.Н. Пономаренко. Сегодня кафедра ведет преподавание физиотерапии, лечебной физической культуры и медицинской реабилитации для курсантов и студентов факультетов подготовки врачей, слушателей циклов последипломного образования по 3 специальностям 18 учебным потокам.
С 1962 г. база кафедры физиотерапии – здание Обуховской больницы
Основными направлениями научных исследований кафедры являются: разработка теоретических основ медицинской реабилитации, приоритетных направлений ее развития (физиогенетика, доказательная, персонализированная и спортивная физиотерапия), изучение лечебных эффектов низкоинтенсивных физических факторов, разработка и апробация новых высокотехнологичных физических методов лечения, оптимизация и стандартизация физических методов лечения пациентов с различными заболеваниями, разработка и практическое внедрение инновационных технологий в физиотерапии и курортологии (высокотехнологичные методы, маркетинг, консалтинг), разработка оптимальных форм организации физиотерапевтической и санаторно-курортной помощи, медицинской реабилитации населению и военнослужащим.
Заведующий кафедрой курортологии и физиотерапии (с курсом медицинской реабилитации) доктор медицинских наук профессор Пономаренко Г. Н.
Коллективом кафедры выпущены несколько учебников для вузов, руководство по частной физиотерапии и национальное руководство по физиотерапии, а также множество монографий по отдельным направлениям физиотерапии. Кафедра является главным учебно-методическим и научным центром МО РФ по всестороннему изучению проблем физиотерапии, курортологии, медицинской реабилитации и лечебной физической культуры. Представителем кафедры является ассистент, кандидат медицинских наук Махоткина Н.Н.